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Estaba intentando ejecutar múltiples trabajos srun dentro de un solo script sbatch en un clúster. El script sbatch es el siguiente: #!/bin/bash #SBATCH -N 1 #SBATCH -n 1 #SBATCH -c 64 #SBATCH –time=200:00:00 #SBATCH -p amd_256 for i in {0..6} ; do cd ${i} ( srun -c 8 ./MD 150 . . . Read more
Estoy intentando ejecutar múltiples (varios cientos) de archivos de trabajo muy similares con slurm usando sbatch. Mi archivo .job se ve así: SBATCH … … … srun ./someProg -a A -b B -c C -d D ¿Existe alguna manera conveniente de enviar el archivo de trabajo utilizando sbatch con múltiples . . . Read more
Estoy ejecutando múltiples trabajos de matriz utilizando slurm. Para un determinado ID de trabajo de matriz, digamos 885881, quiero enumerar el número de trabajos fallidos y completados. Algo como esto: Entrada: <algún-comando> -j 885881 Salida: Supongamos que tenemos 200 trabajos en la matriz. count | estado 120 | fallidos 80 . . . Read more
¿Cómo puedo ejecutar el código de configuración en un script SLURM sbatch? ¿Puedo simplemente usar dos líneas de srun? ¿Estas dos líneas de srun están garantizadas para ejecutarse en el mismo nodo, sin limpieza intermedia? #!/bin/bash # Parámetros # SBATCH … # Configuración srun cp /nfs/data $TMPDIR # Trabajo srun . . . Read more
Necesito ejecutar un script de Python utilizando sbatch / slurm. El script funciona hasta el paso en el que debe utilizar ptemcee (es decir, ejecuta una cadena de Markov de Monte Carlo). En este paso, no ocurre nada (como si el script cayera en un bucle infinito). Sé que no . . . Read more