Alimente el archivo sin comprimir como argumento de línea de comandos.
Digamos que tengo un archivo comprimido en formato gzip, pero mi script solo acepta archivos no comprimidos. ¿Sin modificar el script para que acepte archivos comprimidos, podría descomprimir el archivo sobre la marcha con bash? Por ejemplo: python ../scripts/myscript.py –in (gunzip compressed_file.txt.gz)