Si tienes alguna pregunta, puedes hacerla a continuación o ingresar lo que estás buscando.
En un solucionador de dinámica de fluidos computacional que he desarrollado, obtengo resultados diferentes según el compilador que utilice. Cuando compilo este código usando gfortran con las siguientes banderas: -ffree-line-length-512 -Ofast -march=native, obtengo los resultados “correctos”. Sin embargo, cuando ejecuto el mismo código con pgfortran utilizando las banderas -fast -acc . . . Read more
Soy nuevo en MPI, tengo un arreglo de 256 enteros y quiero dividir cada número por 16. Sugerí distribuir 32 elementos en cada procesador, pero no pude reunirlos ya que cada valor de retorno contiene un arreglo de 32. int globalhistogram[256]; float globalProb[256]; float* localprob = new float[32]; int localpixel[32]; . . . Read more
Estoy intentando crear un snakefile para facilitar la paralelización de varias funciones. Me gustaría crear un único archivo snake que genere archivos en diferentes directorios con diferentes nombres, aunque los pasos no sean necesariamente secuenciales. GENES=[‘A’,’B’,’C’] rule all: input: expand(join(RESULTS_DIR,”{gene}.rds”), gene=GENES) rule essentiality: group: “essentiality” input: ESSENTIALITY_SCREEN params: “{gene}” output: . . . Read more
Tengo que ejecutar una simulación ROS en un HPC. En mi PC local, normalmente abro varias terminales para ejecutar diferentes comandos ros que funcionan juntos como roscore, etc. Ahora no estoy seguro de cómo hacerlo en un HPC, necesito enviar un archivo de trabajo para ello.
Tengo que ejecutar varios pipelines de nextflow en paralelo, sin embargo, al hacerlo, el directorio tmp/ se congestiona. La razón aparente es que aunque hay 30 nodos diferentes disponibles con grandes directorios tmp/, nextflow utiliza solo el primero, que se llena bastante rápido, lo que produce un error de “espacio . . . Read more