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Tengo dos data.tables que proporcionan coordenadas de secuencia en diferentes cromosomas (categorías). Por ejemplo: library(data.table) dt1 <- data.table(chromosome = c(“1”, “1”, “1”, “1”, “X”), start = c(1, 50, 110, 150, 110), end = c(11, 100, 121, 200, 200)) dt2 <- data.table(chromosome = c(“1”, “1”, “X”), start = c(12, 60, 50), . . . Read more
“Cargué un objeto TxDb creado a partir de Gencode y lo consulté para obtener los exones, luego utilicé lapply para obtener todos los ÚLTIMOS exones de cada transcripción que tiene más de 1 exón: #Cargar la base de datos: Gencode <- loadDb(‘gencode.v39.basic.annotation.sqlite’) #Exones por transcripción Exones <- exonsBy(Gencode, by = . . . Read more
Realmente aprecio que estés leyendo esto y tomando tu valioso tiempo para ayudarme con un problema que tengo. En R, me gustaría ordenar los datos de pequeños intervalos continuos de un dataframe a los intervalos (no superpuestos) de tamaño y distribución irregular en otro dataframe para todos los intervalos que . . . Read more