Me gustaría calcular las distancias entre todos los átomos en un archivo PDB y luego crear una matriz de distancias a partir del resultado del PDB. Actualmente tengo todas las coordenadas x, y y z pero tengo dificultades para hacer este cálculo de distancias para todos los átomos. Distancia = . . . Read more
Tengo un archivo con 945 IDs de entrada únicos, y cada uno de estos IDs de entrada tiene una distancia calculada a 1435 IDs de destino únicos. Necesito encontrar la distancia mínima al ID de destino para cada ID de entrada. La distancia se calcula en la columna “Distkm” (consulte . . . Read more
La versión R del paquete igraph contiene la función distances que, según la documentación, devuelve la matriz de distancia del grafo pasado como argumento. Sin embargo, no pude encontrar esta función o una similar en la versión de Python del paquete. La única función proporcionada que pude encontrar es Point.distance, . . . Read more