Tag: CYTOSCAPE
Estoy intentando representar un gráfico en su estado original a partir de un objeto JSON guardado que almacena las matrices de nodos y aristas y todos sus datos respectivos, incluyendo las posiciones x e y. Tengo una función onLoad que se activa cuando se carga la página: const onLoad = . . . Read more
Tengo un archivo de datos JSON que estoy utilizando con Dash/Cytoscape: “data”: { “label”: “Cliente”, “properties”: { “score”: 8.0 } } Necesito comparar ‘score’ con el selector para ver si es mayor que 9. Hasta ahora he intentado: ‘selector’: ‘node[properties[score > 9]]’ ‘selector’: ‘[score > 9]’ ‘selector’: ‘[properties[score > 9]]’ . . . Read more
Disculpa si me he perdido esto en otro lugar, ¿alguien podría decirme por favor si Cytoscape utiliza Log4j? Tengo Cytoscape v3.9.0 en macOS Big Sur v11.6, con openjdk v11.0.7 instalado. Solo me pregunto si es seguro abrir Cytoscape para usarlo en este momento o si necesita una actualización de seguridad.
Soy nuevo en Cytoscape y GSEA, pero estoy intentando construir un mapa de enriquecimiento con mis datos de RNA-seq. He subido el archivo .gmt y dos archivos .xls, uno para el enriquecimiento positivo y otro para el negativo. También tengo un archivo .rnk pero parece que no está causando el . . . Read more
¿Cómo puedo obtener todos los IDs de los nodos en mi lienzo de Cytoscape? Para contexto: Los necesito para pruebas de frontend mediante Selenium.