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Estoy escribiendo un analizador en bash donde tengo un texto con un “:” en cada línea, y necesito mostrar la parte después de dos puntos si la parte antes de los dos puntos coincide con la palabra “txt”. Entonces dividí las líneas del texto usando “:” y luego intenté usar . . . Read more
Estoy tratando de extraer filas de un archivo .csv donde una variable coincide con un identificador específico. Aquí hay un ejemplo de conjunto de datos (myfile.csv): id,x,y,z A01,1,5,7 A02,4,4,7 B01,1,6,6 A01,5,7,4 A01,4,8,4 C02,3,1,3 A01,1,2,3 Podría utilizar lo siguiente: awk -F’,’ ‘{if($1==”A01″) print}’ myfile.csv > outfile.csv o awk -F’,’ ‘{if($1==”A01″) print . . . Read more
Tengo un script que, para cada archivo en un directorio, hace algo con el comando awk. Para eso, uso un bucle for, pero me gustaría que cada comando awk se ejecute para un archivo y redireccione la salida a otro archivo. Es decir, 1 archivo de origen -> 1 archivo . . . Read more
Tengo un archivo CSV que tiene alrededor de 25k filas. Tengo que seleccionar 1000 filas de la columna #1 y la columna #2 a la vez, y luego las siguientes 1000 filas y así sucesivamente. Estoy utilizando el siguiente comando y funciona bien al seleccionar todos los valores de la . . . Read more
Hola, tengo varios archivos cuya línea inicial (o registro) sigue este formato: cat file_1.txt | grep ‘>’ > CP022114.1 Kluyvera georgiana strain YDC799 chromosome, complete genome Quiero extraer el segundo campo de ese registro, que corresponde a la categoría taxonómica de género. En este ejemplo es “Kluyvera”. Para ello, utilizo . . . Read more