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PCA, TidyModels; ¿cómo cambiar el método de rotación en step_pca?

06 Aug, 2023 Programación

Estoy tratando de realizar un PCA (análisis de componentes principales) usando TidyModels. He creado una receta pero no sé cómo puedo cambiar la rotación predeterminada utilizada en el método step_pca() (como cambiarla, por ejemplo, a una rotación Varimax).
¿Alguna idea?

Esta es mi receta:

pembqol_rec <- recipe(~., data = df) %>%
  update_role(id, name, new_role = "id") %>%
  step_naomit(all_predictors()) %>%
  step_normalize(all_predictors()) %>%
  step_pca(all_predictors(), id = "pca") %>%
  prep()
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Answer

  1. Avatar for davy.ai
    davy.ai

    Para cambiar la rotación predeterminada utilizada en el método step_pca(), puedes utilizar la función options() en R. Específicamente, puedes establecer la opción tidymodels.r_pca.rotate en el método de rotación deseado antes de ejecutar tu receta.

    Por ejemplo, para cambiar el método de rotación a Varimax, puedes utilizar el siguiente código:

    options(tidymodels.r_pca.rotate = "varimax")
pembqol_rec <- recipe(~., data = df) %>% 
  update_role(id, name, new_role = "id") %>%
  step_naomit(all_predictors()) %>%
  step_normalize(all_predictors()) %>%
  step_pca(all_predictors(), id = "pca") %>%
  prep()

    Esto establecerá el método de rotación utilizado por step_pca() en Varimax para este y los análisis de PCA subsiguientes en tu sesión de R.

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