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No se encontró el módulo “Bio”.

12 Jul, 2023 Programación

Estoy en OSX y apenas puedo encontrar algo para usuarios de Mac sobre esto. Estoy usando Visual Studio Code, pip 21.3.1 y Python 3.8 como referencia.

Estoy usando “pip install biopython” y todo se instala. De hecho, la pequeña palabra en VSCode se vuelve verde y todo. No hay ninguna advertencia. Pero cuando lo ejecuto desde la terminal, hay un error que dice que el módulo no existe. Agregué la ruta exacta al módulo a mi PATH, pero aún así no funciona. No tengo idea de qué hacer y estoy perdiendo la cabeza. Si no tuviera que usar esto para una clase, lo abandonaría por completo. Lo he desinstalado, reinstalado, movido a diferentes lugares, todo lo que se me ocurre.

Mostraría el código, pero aún no tengo ninguno. Solo estoy tratando de importarlo.

Solo necesito ayuda de alguien que esté más educado que yo en esto.

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Answer

  1. Avatar for davy.ai
    davy.ai

    Según la información proporcionada, parece que el problema está relacionado con el intérprete de Python que no puede encontrar el módulo Biopython. Aquí hay algunas sugerencias que pueden ayudar a resolver el problema:

    1. Verifica tu versión de Python: Asegúrate de que la versión de Python que estás utilizando en la terminal sea la misma versión para la cual instalaste Biopython. Puedes verificar tu versión de Python ejecutando python --version en la terminal.

    2. Verifica la ruta de instalación de pip: Asegúrate de que la ubicación donde pip instaló el paquete Biopython esté en la variable PATH del sistema. Puedes verificar la ruta ejecutando which pip y echo $PATH en la terminal.

    3. Intenta instalar Biopython con sudo: A veces pueden surgir problemas cuando los permisos no están configurados correctamente. Intenta ejecutar sudo pip install biopython en la terminal para instalar Biopython con privilegios elevados.

    4. Utiliza un entorno virtual: En general, es una buena idea utilizar entornos virtuales al trabajar con paquetes de Python para evitar conflictos con otros paquetes/instalaciones del sistema. Puedes crear un entorno virtual para tu proyecto e instalar Biopython en el entorno virtual por separado. Aquí tienes un ejemplo de cómo crear un entorno virtual:

    python3 -m venv my_env
source my_env/bin/activate

    Después de activar el entorno virtual, puedes instalar Biopython con pip como lo harías normalmente:

    pip install biopython
    1. Verifica la configuración de tu entorno de Python: Si ninguna de las sugerencias anteriores funciona, puede valer la pena examinar la configuración de tu entorno de Python. Puede haber instalaciones en conflicto, configuraciones incorrectas de PATH u otros problemas que impidan que se descubra el módulo. Puedes intentar buscar soluciones específicas para tu entorno de Python, como las instalaciones de Anaconda o Homebrew.

    Esperemos que una (o varias) de estas sugerencias te ayude a resolver el problema y hacer que Biopython funcione en tu entorno de Python.

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