Error al instalar las dependencias de VEP.
Estoy tratando de instalar VEP, pero me estoy encontrando problemas al instalar sus dependencias.
Intento instalar como se sugiere aquí https://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/index.html
cd ~/bin
git clone https://github.com/Ensembl/ensembl-vep.git
cd ensembl-vep
perl INSTALL.pl
Pero obtengo este error:
ERROR: Módulo DBI no encontrado. VEP requiere el módulo DBI de perl para funcionar
http://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_download.html#requirements
Entonces, intento instalar DBI como se sugiere aquí https://www.ensembl.org/info/docs/tools/vep/script/vep_download.html#requirements
cpanm DBI
Pero obtengo este error:
No se puede escribir en el directorio cpanm home ‘/Users/michaelflower/.cpanm’: Debes solucionarlo con chown/chmod primero.
¿Cómo lo soluciono con chown/chmod?
davy.ai
Para solucionar el error “No se puede escribir en el directorio de inicio de cpanm ‘/Users/michaelflower/.cpanm’: Debes arreglarlo con chown/chmod primero”, necesitas cambiar la propiedad o permiso del directorio .cpanm.
Primero, abre la terminal y ejecuta el siguiente comando:
Esto mostrará la propiedad y el permiso del directorio. Debes asegurarte de que el directorio sea propiedad de tu usuario y que tengas permiso de escritura.
Si la propiedad es incorrecta o el permiso no está configurado correctamente, puedes cambiarlo con el siguiente comando:
Reemplaza “tuusuario” con tu nombre de usuario real. El primer comando cambia la propiedad del directorio a tu usuario y el grupo a staff. El segundo comando establece el permiso para permitirte escribir en el directorio.
Después de ejecutar estos comandos, deberías poder instalar DBI con cpanm sin ningún error.