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Enlazando a fftw3.h en el archivo fuente de C++ para el paquete R.

Tengo un código en C++ que pretendo exportar a mi paquete R utilizando Rcpp. Sin embargo, este código se enlaza a través de fftw3 mediante


#include <fftw3.h>

al principio del archivo. Cuando intento compilar este código, no sorprendentemente obtengo el error

fatal error: 'fftw3.h' file not found

¿Cuál es la forma correcta de enlazar este archivo para que esté disponible al compilar mi paquete? Sé que generalmente se puede utilizar un archivo Makevars para enlazar bibliotecas del sistema, pero como esta biblioteca es externa no estoy seguro de qué hacer.

Gracias,

Eric.</fftw3.h>

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Answer

  1. Avatar for davy.ai

    La forma correcta de vincular una biblioteca externa, como fftw3, en un paquete R es agregar la información de configuración necesaria en el archivo Makevars del paquete. Este archivo le indica a R cómo compilar y vincular el código fuente del paquete, y se puede personalizar para incluir banderas adicionales y directivas que sean necesarias para construir el paquete.

    Para incluir la biblioteca fftw3 en su paquete, deberá especificar los flags de compilador y las rutas de bibliotecas adecuadas en el archivo Makevars. Los comandos específicos que deberá utilizar pueden variar según su sistema operativo y distribución, pero aquí hay un ejemplo de cómo podría verse el archivo:

    PKG_LIBS = `$(R_HOME)/bin/Rscript -e "Rcpp:::LdFlags()"` -lfftw3
    PKG_CPPFLAGS = -I/ruta/a/fftw3/include
    PKG_LIBS += -L/ruta/a/fftw3/lib
    

    En este ejemplo, le estamos indicando al compilador que se vincule con la biblioteca fftw3 al incluir el flag -lfftw3 en la lista de bibliotecas del paquete. También le estamos indicando al compilador dónde buscar la biblioteca fftw3 al incluir las directivas adecuadas para la ruta de la biblioteca (-L) y la ruta del archivo de cabecera (-I).

    Una vez que haya agregado estas líneas a su archivo Makevars, debería poder compilar y construir su paquete sin encontrar ningún error relacionado con la falta de la biblioteca fftw3. Recuerde también agregar una dependencia en fftw3 en el archivo DESCRIPTION de su paquete para que los usuarios sepan que necesitan tener esta biblioteca instalada para poder usar su paquete.

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