Ejecutando varios archivos de trabajo similares (sbatch)

Answer

1. 

   davy.ai

   July 24, 2023 at 4:25 pm

   Sí, puedes utilizar un script para generar las combinaciones únicas de A/B/C/D y enviarlas utilizando sbatch. Aquí tienes un ejemplo de script en bash:

   #!/bin/bash
   
   for A in valor1 valor2 valor3; do
     for B in valor4 valor5 valor6; do
       for C in valor7 valor8 valor9; do
         for D in valor10 valor11 valor12; do
           # Crear un nombre único para el trabajo basado en los valores de A/B/C/D
           nombre_trabajo="trabajo-$A-$B-$C-$D"
   
           # Escribir el archivo del trabajo, reemplazando los valores de A/B/C/D según sea necesario
           cat > $nombre_trabajo.job <<eof
   #sbatch ...
   ...
   ...
   srun ./algúnprograma -a $a -b $b -c $c -d $d
   eof
   
           # enviar el trabajo utilizando sbatch
           sbatch $nombre_trabajo.job
         done
       done
     done
   done
   

   este script utiliza bucles anidados para generar todas las posibles combinaciones de a/b/c/d. para cada combinación, crea un nombre único para el archivo de trabajo basado en los valores de a/b/c/d, escribe el archivo de trabajo con los valores adecuados de a/b/c/d y luego envía el trabajo utilizando sbatch.

   ten en cuenta que esto generará muchos archivos de trabajo (en este ejemplo, 273=81). si tienes un gran número de combinaciones, es posible que debas dividirlas en lotes y enviarlas por separado para evitar sobrecargar el programador. #sbatch=”” …=”” …=”” …=”” srun=”” ./algúnprograma=”” -a=”” $a=”” -b=”” $b=”” -c=”” $c=”” -d=”” $d=”” eof=”” #=”” enviar=”” el=”” trabajo=”” utilizando=”” sbatch=”” sbatch=”” $nombre_trabajo.job=”” done=”” done=”” done=”” done=”” “`=”” este=”” script=”” utiliza=”” bucles=”” anidados=”” para=”” generar=”” todas=”” las=”” posibles=”” combinaciones=”” de=”” a/b/c/d.=”” para=”” cada=”” combinación,=”” crea=”” un=”” nombre=”” único=”” para=”” el=”” archivo=”” de=”” trabajo=”” basado=”” en=”” los=”” valores=”” de=”” a/b/c/d,=”” escribe=”” el=”” archivo=”” de=”” trabajo=”” con=”” los=”” valores=”” adecuados=”” de=”” a/b/c/d=”” y=”” luego=”” envía=”” el=”” trabajo=”” utilizando=”” sbatch.=”” ten=”” en=”” cuenta=”” que=”” esto=”” generará=”” muchos=”” archivos=”” de=”” trabajo=”” (en=”” este=”” ejemplo,=”” 273=”81).” si=”” tienes=”” un=”” gran=”” número=”” de=”” combinaciones,=”” es=”” posible=”” que=”” debas=”” dividirlas=”” en=”” lotes=”” y=”” enviarlas=”” por=”” separado=”” para=”” evitar=”” sobrecargar=”” el=””></eof
   #sbatch …
   …
   …
   srun ./algúnprograma -a $a -b $b -c $c -d $d
   eof

       # enviar el trabajo utilizando sbatch
       sbatch $nombre_trabajo.job
     done
   done
   

   done
   done
   “`

   este script utiliza bucles anidados para generar todas las posibles combinaciones de a/b/c/d. para cada combinación, crea un nombre único para el archivo de trabajo basado en los valores de a/b/c/d, escribe el archivo de trabajo con los valores adecuados de a/b/c/d y luego envía el trabajo utilizando sbatch.

   ten en cuenta que esto generará muchos archivos de trabajo (en este ejemplo, 27*3=81). si tienes un gran número de combinaciones, es posible que debas dividirlas en lotes y enviarlas por separado para evitar sobrecargar el programador.>

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