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Convirtiendo un archivo XML a un archivo CSV.

12 Jun, 2023 Programación

Intento convertir un archivo .XML a Excel utilizando la librería R XML. Sin embargo, obtengo un error que no puedo decodificar.

Por favor, ayúdame a decodificar el error. Sí, soy un aficionado a la programación. Pero aquí está mi código y el error.

library(XML)
mydata <- xmlParse("2021-11-29-alp_gene_3.xml")
mydata1 <- xmlToList(mydata)
mydata3 <- do.call(rbind.data.frame, mydata1)

Error en:

functión (..., 
        nivel.deparse = 1, 
        nombres.fila = TRUE, 
        stringsAsFactors = FALSE,  : 
        argumento de lista inválido: todas las variables deben tener la misma longitud
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Answer

  1. Avatar for davy.ai
    davy.ai

    A partir del código proporcionado, parece que hay un problema al intentar unir los marcos de datos en un solo marco de datos. El mensaje de error sugiere que las variables en la lista (mydata1) no tienen la misma longitud.

    Para depurar este error, puede intentar los siguientes pasos:

    1. Verifique la estructura del archivo XML utilizando la función xmlTreeParse() para comprender la jerarquía de los datos.

    2. Convierta el XML en un marco de datos utilizando la función xmlToDataFrame() en lugar de xmlToList(). Esta función puede manejar estructuras XML más complejas.

    3. Verifique la estructura y dimensiones del marco de datos resultante.

    4. Asegúrese de que todas las columnas del marco de datos tengan la misma longitud.

    Aquí está el código modificado para el paso 2:

    library(XML)
mydata <- xmlParse("2021-11-29-alp_gene_3.xml")
mydata_df <- xmlToDataFrame(mydata)

    Si este código aún genera un error, es posible que deba proporcionar más información sobre el archivo XML y su estructura para identificar la causa raíz.

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