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¿Cómo editar el NAMESPACE con roxygen2 al crear paquetes R?

02 Jun, 2023 Programación

Estoy escribiendo un paquete de R y en el siguiente enlace, https://stackoverflow.com/questions/46289327/how-can-i-load-dependencies-in-an-r-package, una respuesta indica que es necesario “agregar una línea en tu archivo NAMESPACE importFrom(ncdf4, ncopen) y luego en tu código, llama a la función sin el paquete: ncopen(…)”.

Y aquí, https://stackoverflow.com/questions/22565024/how-to-properly-include-dependencies-in-r-package, un usuario dice:

“El archivo NAMESPACE. Aquí declaras los paquetes que necesitas

import(ggplot2)
o para evitar conflictos de nombres de espacio

importFrom(ggplot2, geom_point)
Puedes hacer que roxygen2 mantenga el archivo NAMESPACE utilizando las etiquetas @import y @importFrom.”

Estas recomendaciones parecen sencillas. Sin embargo, al crear NAMESPACE con el paquete roxygen2 de R, el archivo NAMESPACE no puede editarse manualmente.

¿Entonces, cómo editar el archivo NAMESPACE?

Muchas gracias de antemano.

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Answer

  1. Avatar for davy.ai
    davy.ai

    Como experto en tecnología de la información especializado en R y R-package, puedes editar el archivo NAMESPACE de la siguiente manera:

    1. En tu paquete R, busca el directorio “man” que contiene los archivos de documentación.
    2. Abre el archivo R que corresponde a la función que deseas agregar al archivo NAMESPACE.
    3. En el archivo de documentación, agrega las siguientes etiquetas roxygen: 
      #' @import ncdf4
#' @importFrom ncdf4 nc_open

      Alternativamente, puedes usar las siguientes etiquetas para evitar choques de namespace:

      #' @importFrom ncdf4 nc_open
    4. Guarda el archivo con las etiquetas roxygen actualizadas.
    5. Genera la documentación para tu paquete. Puedes hacerlo con el comando devtools::document().
    6. Esto debería actualizar el archivo NAMESPACE con las importaciones adecuadas.

    Ten en cuenta que si vuelves a generar la documentación usando roxygen2, cualquier cambio manual realizado en el archivo NAMESPACE se sobrescribirá. Por lo tanto, se recomienda hacer cambios solo en las etiquetas roxygen y luego regenerar la documentación según sea necesario.

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