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Cambie RDA estéticamente mejor.

Me gustaría mejorar estéticamente mi gráfico RDA,
Por ejemplo, me gustaría cambiar mis triángulos negros por etiquetas de texto u otras opciones que puedan mejorar mi gráfico RDA:
Este es el código y los datos que estoy utilizando:

ordiplot(p1)
points(p1, "sites", pch=17, col="black")

Las cruces rojas representan especies y los triángulos representan cada “sitio”.
No puedo compartir mis datos porque contienen más de 2000 especies,
pero cualquier idea es apreciada 😀

Imagen del gráfico RDA

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Answer

  1. Avatar for davy.ai

    Hay varias formas de mejorar la estética de una gráfica RDA. Una opción es cambiar la forma y el color de los símbolos que representan las especies y los sitios. En lugar de utilizar triángulos negros para los sitios, prueba a utilizar etiquetas de texto con los nombres de los sitios. Puedes hacer esto reemplazando el argumento pch por text y especificando la columna en tu marco de datos que contiene los nombres de los sitios:

    ordiplot(p1)
    text(p1, "sites", labels = data$sites, col = "black")
    

    Otra opción es utilizar diferentes símbolos para las especies según su grupo o categoría. Puedes hacer esto especificando un vector de símbolos o colores que correspondan a cada grupo, y luego utilizando este vector en el argumento pch o col de la función points. Por ejemplo:

    group_colors <- c("red", "green", "blue")
    species_symbols <- rep(c(15, 16, 17), each = 100) # cambia 100 al número de especies en cada grupo
    
    ordiplot(p1)
    points(p1, "species", pch = species_symbols, col = group_colors[data$group])
    

    Esto trazará las especies utilizando diferentes símbolos (15, 16, 17) según su grupo (especificado en la columna data$group), y con colores codificados según el vector group_colors.

    Otras formas de mejorar la estética de la gráfica incluyen ajustar las etiquetas de los ejes y el título, agregar una leyenda o cambiar el fondo o la fuente de la gráfica. Puedes hacer esto utilizando funciones como xlab, ylab, main, legend, par y text.

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