símbolo indefinido: _PyThreadState_Current al usar código C++ envuelto con pybind
Cuando ejecuto bazel test ...
, el código en cpp se compila, pero Python se bloquea.
Leí esto antes de escribir esta pregunta, pero no puedo encontrar ninguna solución:
https://github.com/pybind/pybind11/issues/314
https://stackoverflow.com/questions/56002315/undefined-symbol-pythreadstate-current-when-importing-tensorflow
https://github.com/carla-simulator/ros-bridge/issues/368
https://python-forum.io/thread-32297.html
SO:
Linux 5.11.0-43-generic #47~20.04.2-Ubuntu SMP Mon Dec 13 11:06:56 UTC 2021 x86_64 x86_64 x86_64 GNU/Linux
Python: Python 3.8.10
g++: g++ (Ubuntu 9.3.0-17ubuntu1~20.04) 9.3.0
pybind11: v2.8.1
Código C++:
//math.cc
#include <pybind11 pybind11.h="">
int add(int i, int j) {
return i + j;
}
int subtract(int i, int j) {
return i - j;
}
namespace py = pybind11;
PYBIND11_MODULE(math, m) {
m.def("add", &add);
m.def("subtract", &subtract);
}
Código Python:
# math_test.py
from module import t_math
assert t_math.add(1, 1) == 2
assert t_math.subtract(1, 1) == 0
BUILD:
load("@pybind11_bazel//:build_defs.bzl", "pybind_extension")
pybind_extension(
name = "t_math",
srcs = ["math.cc"],
)
py_test(
python_version = "PY3",
name = "math_test",
size = "small",
srcs = ["math_test.py"],
data = [":t_math.so"],
)
error:
Traceback (most recent call last):
File “/home/user/.cache/bazel/bazel-user/a768e2cde210bf677ee66cfded678e04/sandbox/linux-sandbox/52/execroot/main/bazel-out/k8-fastbuild/bin/module/math_test.runfiles/main/module/math_test.py”,
line 7, in
from module import t_math
ImportError: /home/user/.cache/bazel/bazel-user/a768e2cde210bf677ee66cfded678e04/sandbox/linux-sandbox/52/execroot/main/bazel-out/k8-fastbuild/bin/module/math_test.runfiles/main/module/t_math.so:
undefined symbol: _PyThreadState
davy.ai
El mensaje de error sugiere que el código Python no puede importar el módulo
t_math
porque le falta el símbolo_PyThreadState_Current
. Esto podría deberse a una inconsistencia entre la versión de Python utilizada para construir el módulo y la utilizada para ejecutar la prueba.Una posible solución es reconstruir el módulo pybind11 utilizando la versión de Python utilizada para ejecutar la prueba (
Python 3.8.10
). Otra solución es enlazar dinámicamentelibpython3.so
al módulo pybind11 agregando-L/usr/lib/python3.8/config-3.8-x86_64-linux-gnu -lpython3.8
a las opciones de construcción.Además, puede ser útil verificar si las dependencias y bibliotecas requeridas están instaladas correctamente y si las opciones de construcción y rutas están configuradas correctamente. Los enlaces proporcionados en la pregunta ofrecen discusiones detalladas adicionales sobre problemas similares, que pueden ser útiles para resolver el problema.