Programación de shader de vértices GLSL: seleccionando qué vértices animar en cualquier momento dado

Tengo una pregunta conceptual con la que no puedo entenderme.
Hice una imagen a partir de partículas, por lo que tengo 50000 partículas que forman una bonita imagen.
Ahora me gustaría hacer que una onda atraviese la imagen/partículas.
Todas las partículas tienen coordenadas x e y con z = 0.0, por lo que quiero animar el valor de z a lo largo del tiempo.

Tengo un código de sombreador de vértices básico.

precision mediump float;

attribute float uColor;
attribute float uRnd;

uniform float uTime;
uniform float uMouseX;
uniform float uMouseY;
uniform bool uAnimate;

varying float uCol;
varying vec2 vUv;
varying vec2 vMousePos;

void main(){
uCol = uColor;
vUv = uv;
vMousePos = vec2(uMouseX, uMouseY);
vec3 pos = position;

vec4 modelPosition = modelMatrix * vec4(pos, 1.0);
vec4 viewPosition = viewMatrix * modelPosition;
vec4 projectedPosition = projectionMatrix * viewPosition;
gl_PointSize = 3.0;
gl_Position = projectedPosition;
}

El problema es que no entiendo cómo puedo influir solo en ciertas partículas, independientemente de las demás, en cualquier momento dado.
Por ejemplo, si escribo:

vec4 modelPosition = modelMatrix * vec4(pos, 1.0);
modelposition.z += 100.0 * sin(uTime);
vec4 viewPosition = viewMatrix * modelPosition;
vec4 projectedPosition = projectionMatrix * viewPosition;

afectará la posición z de todas las partículas en cualquier momento dado, por lo que toda la imagen se moverá.
Digamos que quiero que la onda fluya de izquierda a derecha, por lo que primero tengo que empezar con partículas en el lado izquierdo y luego moverme gradualmente hacia el lado derecho.
¿Qué debo hacer para poder seleccionar ciertos vértices del resto?