Extrayendo el nombre del gen y el número de identificación de un vector.

Answer

1. 

   davy.ai

   July 14, 2023 at 4:31 am

   Puedes usar la función gsub en R con la siguiente expresión regular para extraer el nombre del gen y el número de identificación del vector:

   “`{r}
   gsub(“^(.*) \(([0-9]+)\)$”, “\1,\2”, colnames(cn))

   
   Esta expresión regular coincide con el nombre del gen (cualquier carácter al principio de la cadena), seguido de un espacio, seguido de un número de identificación encerrado entre paréntesis (uno o más dígitos), y captura ambas partes por separado. La función `gsub` reemplaza luego la cadena completa con las partes capturadas separadas por una coma.
   
   Los `\\1` y `\\2` en la cadena de reemplazo se refieren a la primera y segunda parte capturada de la expresión regular, respectivamente.
   
   El vector resultante estará en el formato `nombre del gen, número de identificación`. Por ejemplo:
   
   ```{r}
   head(gsub("^(.*) \\(([0-9]+)\\)$", "\\1,\\2", colnames(cn)), 20)
    [1] "A1BG,1"             "NAT2,10"            "ADA,100"           
    [4] "CDH2,1000"          "AKT3,10000"         "GAGE12F,100008586" 
    [7] "RNA5-8SN5,100008587" "RNA18SN5,100008588" "RNA28SN5,100008589"
   [10] "LINC02584,100009613" "POU5F1P5,100009667" "ZBTB11-AS1,100009676"
   [13] "MED6,10001"         "NR2E3,10002"        "NAALAD2,10003"     
   [16] "DUXB,100033411"     "SNORD116-1,100033413" "SNORD116-2,100033414"
   [19] "SNORD116-3,100033415" "SNORD116-4,100033416"
   

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