Cargue datos de un archivo a otro en función de la parte coincidente en dos archivos.
Entrada1
>Aa,Ab,Ac,ET0001
>Ba,Bb,Bc,ET0002
>Ca,Cb,Cc,ET0003
Entrada2
>Infor_a, aa:dfkvl, bb:csd, cc:ET0001
sldcksdlksjelkjfslkdjflskdjflskd
sldkcmowdimnwo
>Infor_b, aa:coeq, bb:ock, cc:ET0056
lskdjocisnmodk
>Infor_c, aa:vwjm, bb:cxj, cc:ET0751
spodcisdokfmnwoke
woeinmfwoeinflsdkvm
sldknmflwkenmlwk
>Infor_d, aa:wokx, bb:rkx, cc:ET0003
sodicjsodijsoi
Salida esperada
>Aa,Ab,Ac,ET0001
sldcksdlksjelkjfslkdjflskdjflskd
sldkcmowdimnwo
>Ba,Bb,Bc,ET0002
NaN
>Ca,Cb,Cc,ET0003
sodicjsodijsoi
Código
with open(input1, 'r') as fr1, open(input2, 'r') as fr2, open(output, 'w') as fw:
temp = []
while (fr2):
line2 = fr2.readline()
if line2.startswith('>'):
templist = line2.strip().split()
for element in templist:
if element.startswith('cc:ET'):
replaced_element = element.replace('cc:','')
temp.append(replaced_element)
if not line2:
break
for line1 in fr1:
line1 = line1.strip()
if line1.split(',')[3] in temp:
fw.write(line1+'\n')
info = fr2.readline()
while info and not info.startswith('>'):
fw.write(info)
info = fr2.readline()
if not info:
break
else:
fw.write(line1+'\nNaN\n')
Agrego los datos que comienzan con ‘ET’ de ‘entrada2’ en una lista temporal.
- Quiero obtener la información bajo ‘>’ que coincida con ‘ETnumber’ en ‘entrada2’.
- Si hay una coincidencia entre ‘ETnumber’ y ‘entrada1’, quiero escribir la información bajo ‘>’ debajo de cada línea de ‘entrada1’.
¿Tiene alguna sugerencia para mí, el siguiente paso de mi código (con os.listdir)?
davy.ai
Como modelo de lenguaje de inteligencia artificial, no tengo acceso a su sistema local para ver el contenido del directorio, por lo que no puedo proporcionar recomendaciones específicas para los próximos pasos. Sin embargo, basado en el código proporcionado y la entrada/salida, parece que necesita seguir iterando a través de las líneas de
input2y comparando los valores deETnumberextraídos con los valores deETnumbereninput1. Si hay una coincidencia, debe escribir la línea deinput2en el archivo de salida debajo de la línea coincidente eninput1. Deberá realizar un seguimiento de qué línea está eninput1mientras itera a través deinput2. Una vez que haya terminado de iterar a través de ambos archivos, es posible que desee escribir las líneas restantes deinput1en el archivo de salida si no tenía unETnumbercorrespondiente eninput2.