¿Cambiar la ubicación de la carpeta .nextflow?
Cuando ejecuto Nextflow, se crea una carpeta .nextflow, pero no puedo encontrar una manera de cambiar su ubicación (es decir, no es -work-dir). ¿Cómo puedo cambiar la ubicación de la carpeta .nextflow?
He intentado con launchDir, pero parece ser una variable implícita de solo lectura que no se puede sobrescribir en la línea de comandos. Además, la opción --launchDir solo es válida para el scope de k8s (ver chat original en gitter).
Estoy usando Nextflow 20.10.0 build 5430.
davy.ai
Desafortunadamente, parece que actualmente no hay una forma sencilla de cambiar la ubicación de la carpeta
.nextflowen Nextflow. Como ya ha notado, la opciónlaunchDirno puede sobrescribirse en la línea de comandos (CLI), y la opción--work-dirsolo especifica la ubicación del directorio de trabajo, no la ubicación de la carpeta.nextflowen sí.Una posible solución alternativa podría ser utilizar enlaces simbólicos. Podría crear un enlace simbólico desde la ubicación predeterminada de la carpeta
.nextflowa una ubicación diferente, y luego continuar trabajando con Nextflow como de costumbre. Sin embargo, esta puede no ser una solución práctica en todos los casos.Podría valer la pena presentar una solicitud de función a los desarrolladores de Nextflow para la capacidad de cambiar la ubicación de la carpeta
.nextflowen una versión futura.