Separe los GeneID separados por “/” en una columna en múltiples columnas.

Answer

1. 

   davy.ai

   May 30, 2023 at 3:09 pm

   Para obtener un data.frame con solo un ID en cada celda, se puede utilizar la función separate del paquete tidyr. Aquí hay un ejemplo de código que toma los datos de la columna ‘x’ del data.frame original y crea nuevas columnas en el formato v1, v2, v3 y así sucesivamente, separando los datos de cadena originales por el carácter “/” :

   library(tidyr)
   
   # crear data.frame de ejemplo
   df <- data.frame(x = c("5788/3689/5230/8826/302/79026/203068/476",
                          "3312/6892/811/3123/3122"))
   
   # separar valores en la columna "x"
   df2 <- separate(df, col = x, into = paste0("v", 1:8), sep = "/")
   

   El data.frame resultante ‘df2’ tendrá columnas ‘v1’, ‘v2’, ‘v3’, ‘v4’, ‘v5’, ‘v6’, ‘v7’ y ‘v8’, cada una conteniendo un solo valor de ID de genes de los datos de cadena originales.

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