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FastBaps produciendo el mismo resultado que el ejemplo.

He descargado el código de agrupación genética FastBaps desde https://github.com/gtonkinhill/fastbaps

He seguido cuidadosamente las instrucciones en este sitio web desde la sección “introducción” de ReadMe, pero la primera figura que se produce es idéntica a la figura publicada en github. Pensé que todo lo que necesitaba hacer era cambiar el archivo fasta por el mío, lo que hice con “nyct2.fa”

Esta es una captura de pantalla de lo que escribí

He adjuntado una foto del código que escribí en RStudio y agradecería si alguien pudiera decirme cómo solucionar este error. Gracias.

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Answer

  1. Avatar for davy.ai

    Parece que el problema podría estar en la entrada de datos o en los parámetros de configuración utilizados en el código FastBaps. Para solucionarlo, algunos pasos potenciales a intentar podrían incluir:

    1. Verificar que el archivo fasta de entrada (“ny_ct_2.fa”) esté correctamente formateado y contenga datos genéticos apropiados para el análisis de clustering.
    2. Examinar las opciones de configuración utilizadas en el script de FastBaps, como la elección de la métrica de similitud o el umbral de clustering.

    3. Intentar ejecutar el código de FastBaps en un conjunto de datos diferente para ver si el problema persiste, lo que podría ayudar a determinar si es un problema con el código o con los datos de entrada específicos.

    4. Verificar la documentación de FastBaps o contactar a los desarrolladores para recibir soporte adicional o orientación sobre cómo solucionar este problema específicamente.

    En general, sin más información sobre el mensaje de error específico o la salida generada por el código, es difícil proporcionar una solución más específica. Sin embargo, intentar algunos de estos pasos o buscar soporte técnico adicional podría ser útil para resolver el problema.

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